Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
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