Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RPS29P62273 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
RPS29P62273 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
RPS29P62273 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
RPS29P62273 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
RPS29P62273 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
RPS29P62273 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
RPS29P62273 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
RPS29P62273 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.1
RPS29P62273 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.1
RPS29P62273 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
RPS29P62273 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
RPS29P62273 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
RPS29P62273 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
RPS29P62273 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RPS29P62273 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RPS29P62273 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
RPS29P62273 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
RPS29P62273 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RPS29P62273 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
RPS29P62273 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RPS29P62273 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RPS29P62273 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
RPS29P62273 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RPS29P62273 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RPS29P62273 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RPS29P62273 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RPS29P62273 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
RPS29P62273 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RPS29P62273 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
RPS29P62273 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RPS29P62273 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RPS29P62273 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RPS29P62273 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RPS29P62273 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RPS29P62273 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RPS29P62273 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
RPS29P62273 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RPS29P62273 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RPS29P62273 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RPS29P62273 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
RPS29P62273 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
RPS29P62273 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
RPS29P62273 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
RPS29P62273 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RPS29P62273 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
RPS29P62273 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RPS29P62273 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
RPS29P62273 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
RPS29P62273 LINC01862-201ENST00000593792 478 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
RPS29P62273 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RPS29P62273 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
RPS29P62273 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
RPS29P62273 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
RPS29P62273 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RPS29P62273 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
RPS29P62273 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RPS29P62273 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
RPS29P62273 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
RPS29P62273 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
RPS29P62273 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
RPS29P62273 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RPS29P62273 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
RPS29P62273 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
RPS29P62273 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
RPS29P62273 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
RPS29P62273 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
RPS29P62273 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
RPS29P62273 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RPS29P62273 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
RPS29P62273 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RPS29P62273 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
RPS29P62273 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RPS29P62273 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RPS29P62273 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RPS29P62273 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RPS29P62273 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RPS29P62273 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RPS29P62273 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RPS29P62273 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RPS29P62273 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RPS29P62273 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RPS29P62273 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
RPS29P62273 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RPS29P62273 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RPS29P62273 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RPS29P62273 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RPS29P62273 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
RPS29P62273 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RPS29P62273 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RPS29P62273 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RPS29P62273 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RPS29P62273 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RPS29P62273 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RPS29P62273 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RPS29P62273 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RPS29P62273 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RPS29P62273 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RPS29P62273 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
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