Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AL078621.1-201ENST00000272567 768 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 DEFB121-202ENST00000376314 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 ALOX5AP-201ENST00000380490 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 TRAV8-3-201ENST00000390435 341 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP207-201ENST00000390874 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP115-201ENST00000411160 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC002480.3-201ENST00000439823 557 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 UBQLN4P2-201ENST00000446233 948 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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ANKRD39Q53RE8 PSPC1P2-201ENST00000455130 225 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AL357143.1-201ENST00000457239 934 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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ANKRD39Q53RE8 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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ANKRD39Q53RE8 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 ACTG1P20-201ENST00000486001 468 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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ANKRD39Q53RE8 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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ANKRD39Q53RE8 AC008514.1-201ENST00000521965 602 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 ZNF345-205ENST00000526123 458 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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ANKRD39Q53RE8 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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ANKRD39Q53RE8 AL135978.1-201ENST00000553618 1266 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC005476.2-202ENST00000554634 464 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 RN7SL785P-201ENST00000578437 253 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 LINC01916-201ENST00000582028 559 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 SRP68P1-201ENST00000584247 269 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 RN7SL192P-201ENST00000584303 299 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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ANKRD39Q53RE8 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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ANKRD39Q53RE8 Metazoa_SRP.204-201ENST00000611908 247 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC013553.3-201ENST00000612943 615 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 RN7SL428P-201ENST00000613848 247 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 RN7SL331P-201ENST00000618054 247 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC009220.2-201ENST00000489759 1751 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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