Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 SMIM30-201ENST00000397764 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 RPS21P1-201ENST00000434479 247 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AL133304.3-201ENST00000550089 477 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 CMC2-213ENST00000565914 528 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC003991.1-201ENST00000594469 484 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC138904.2-201ENST00000614412 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Q1T7F1 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Q1T7F1 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Q1T7F1 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Q1T7F1 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Q1T7F1 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Q1T7F1 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Q1T7F1 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Q1T7F1 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Q1T7F1 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Q1T7F1 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
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