Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC090993.1-201ENST00000522460 582 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
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