Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AL445647.2-201ENST00000615170 130 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC85BQ15834 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
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