Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
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CDH18Q13634 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
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CDH18Q13634 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
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