Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.7 ms