Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms