Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
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