Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
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