Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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GRIK2Q13002 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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GRIK2Q13002 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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GRIK2Q13002 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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GRIK2Q13002 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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GRIK2Q13002 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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GRIK2Q13002 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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