Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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FOXD4Q12950 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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