Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms