Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
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PGGT1BP53609 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
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PGGT1BP53609 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
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PGGT1BP53609 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
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PGGT1BP53609 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
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PGGT1BP53609 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
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PGGT1BP53609 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
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PGGT1BP53609 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
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PGGT1BP53609 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
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