Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 IQCJ-SCHIP1-AS1-201ENST00000460574 508 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
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