Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
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USP31Q70CQ4 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
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USP31Q70CQ4 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
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USP31Q70CQ4 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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USP31Q70CQ4 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
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USP31Q70CQ4 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
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USP31Q70CQ4 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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USP31Q70CQ4 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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USP31Q70CQ4 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP31Q70CQ4 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
USP31Q70CQ4 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
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USP31Q70CQ4 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
USP31Q70CQ4 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
USP31Q70CQ4 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP31Q70CQ4 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP31Q70CQ4 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP31Q70CQ4 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP31Q70CQ4 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
USP31Q70CQ4 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
USP31Q70CQ4 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
USP31Q70CQ4 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP31Q70CQ4 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
USP31Q70CQ4 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP31Q70CQ4 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
USP31Q70CQ4 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP31Q70CQ4 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
USP31Q70CQ4 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
USP31Q70CQ4 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
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