Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Q1T7F1 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Q1T7F1 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Q1T7F1 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Q1T7F1 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Q1T7F1 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Q1T7F1 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC022898.1-202ENST00000560864 806 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC005479.3-201ENST00000602790 431 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Q1T7F1 C5orf63-208ENST00000607731 478 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Q1T7F1 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
Q1T7F1 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Q1T7F1 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Q1T7F1 EXOC1L-202ENST00000636125 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Q1T7F1 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
Q1T7F1 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
Q1T7F1 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 HIBCH-207ENST00000410045 854 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 SAP18P3-201ENST00000449663 396 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 RN7SL145P-201ENST00000469955 296 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC025766.1-201ENST00000514061 409 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC018620.1-201ENST00000523233 379 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC009167.1-201ENST00000568317 579 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC136443.4-201ENST00000568759 579 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 BOLA2P1-201ENST00000584794 232 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 MUC1-221ENST00000610359 1101 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 MUC1-227ENST00000615517 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AL359742.1-201ENST00000622497 540 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms