Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FXNQ16595 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FXNQ16595 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FXNQ16595 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FXNQ16595 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FXNQ16595 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FXNQ16595 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FXNQ16595 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FXNQ16595 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FXNQ16595 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FXNQ16595 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FXNQ16595 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FXNQ16595 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FXNQ16595 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FXNQ16595 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FXNQ16595 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FXNQ16595 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FXNQ16595 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FXNQ16595 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FXNQ16595 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FXNQ16595 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FXNQ16595 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FXNQ16595 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FXNQ16595 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FXNQ16595 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FXNQ16595 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FXNQ16595 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FXNQ16595 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FXNQ16595 WDR11-AS1-201ENST00000451706 1108 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FXNQ16595 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FXNQ16595 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FXNQ16595 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FXNQ16595 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FXNQ16595 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FXNQ16595 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FXNQ16595 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FXNQ16595 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FXNQ16595 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FXNQ16595 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FXNQ16595 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
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FXNQ16595 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FXNQ16595 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FXNQ16595 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
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FXNQ16595 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FXNQ16595 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FXNQ16595 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
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FXNQ16595 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
FXNQ16595 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
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FXNQ16595 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FXNQ16595 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FXNQ16595 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
FXNQ16595 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
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FXNQ16595 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FXNQ16595 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FXNQ16595 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FXNQ16595 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FXNQ16595 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FXNQ16595 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FXNQ16595 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FXNQ16595 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FXNQ16595 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FXNQ16595 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FXNQ16595 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FXNQ16595 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FXNQ16595 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FXNQ16595 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FXNQ16595 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FXNQ16595 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FXNQ16595 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FXNQ16595 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FXNQ16595 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FXNQ16595 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FXNQ16595 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FXNQ16595 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
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