Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BRD3Q15059 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122 ms