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| BRD3 | Q15059 | AC012414.7-202 | ENST00000622705 | 1090 nt | BASIC | 5.12 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | CRISP1-202 | ENST00000335847 | 1911 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.12 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | SEPT7P7-201 | ENST00000420492 | 1301 nt | BASIC | 5.12 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | IQGAP2-203 | ENST00000396234 | 3376 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.12 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | LINC02426-201 | ENST00000550506 | 1372 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.12 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | RIMS1-206 | ENST00000425662 | 2799 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.12 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | MBNL3-201 | ENST00000370839 | 1575 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 5.12 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL445487.1-201 | ENST00000415694 | 1580 nt | BASIC | 5.12 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC010132.3-201 | ENST00000442788 | 2430 nt | APPRIS P5 TSL 5 BASIC | 5.12 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | GPR180-201 | ENST00000376958 | 8822 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.11 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | MNDA-201 | ENST00000368141 | 1752 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.11 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | MARCH1-201 | ENST00000274056 | 5367 nt | APPRIS P1 TSL 4 BASIC | 5.11 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | COA1-201 | ENST00000223336 | 927 nt | APPRIS P3 TSL 2 BASIC | 5.11 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | RPL23P2-201 | ENST00000320371 | 421 nt | BASIC | 5.11 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | FABP7-202 | ENST00000368444 | 1026 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.11 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | MIR223-201 | ENST00000385204 | 110 nt | BASIC | 5.11 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | HIGD1C-201 | ENST00000398455 | 371 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.11 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL024474.1-201 | ENST00000404655 | 591 nt | BASIC | 5.11 | □□□□□ -1.59 | | |
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| BRD3 | Q15059 | LINC00301-204 | ENST00000532591 | 470 nt | TSL 2 BASIC | 5.11 | □□□□□ -1.59 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AC022367.1-202 | ENST00000535066 | 537 nt | TSL 3 BASIC | 5.11 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | RAP1B-224 | ENST00000541216 | 701 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.11 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC117377.1-201 | ENST00000547633 | 1038 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.11 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | TEX49-202 | ENST00000548380 | 573 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.11 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC023906.4-201 | ENST00000557898 | 895 nt | TSL 3 BASIC | 5.11 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC134312.3-201 | ENST00000566155 | 213 nt | TSL 2 BASIC | 5.11 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC083899.3-201 | ENST00000603413 | 594 nt | BASIC | 5.11 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | DUXAP3-201 | ENST00000603616 | 594 nt | BASIC | 5.11 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC113368.1-201 | ENST00000603736 | 382 nt | BASIC | 5.11 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | SUMO2P15-201 | ENST00000604285 | 278 nt | BASIC | 5.11 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | DAOA-AS1_2.2-201 | ENST00000610818 | 204 nt | BASIC | 5.11 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | C1orf185-204 | ENST00000612209 | 899 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 5.11 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC009318.4-201 | ENST00000620496 | 486 nt | BASIC | 5.11 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | ST6GALNAC3-203 | ENST00000621530 | 617 nt | TSL 5 BASIC | 5.11 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | RARSP1-201 | ENST00000542842 | 1418 nt | BASIC | 5.11 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | PREPL-205 | ENST00000409411 | 4725 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.11 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | HPGDS-201 | ENST00000295256 | 1636 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.11 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC021355.1-202 | ENST00000519996 | 1633 nt | TSL 2 BASIC | 5.11 | □□□□□ -1.59 | | |
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| BRD3 | Q15059 | C6orf10-205 | ENST00000527965 | 2076 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 5.11 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | MUM1L1-202 | ENST00000357175 | 4173 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 5.11 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | ERGIC2-201 | ENST00000360150 | 5014 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.11 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | TMEM68-202 | ENST00000434581 | 2549 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 5.11 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | OR5H14-202 | ENST00000641380 | 7323 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.1 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | OR9Q2-202 | ENST00000641291 | 3774 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.1 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | ADGRL3-202 | ENST00000504896 | 4816 nt | TSL 5 BASIC | 5.1 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | KLRC4-201 | ENST00000309384 | 930 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.1 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | TMEM255A-202 | ENST00000371352 | 2879 nt | TSL 2 BASIC | 5.1 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | BCAP29-203 | ENST00000379119 | 5773 nt | TSL 3 BASIC | 5.1 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | FCF1P5-201 | ENST00000406490 | 482 nt | BASIC | 5.1 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | C4BPAP1-201 | ENST00000415474 | 1893 nt | BASIC | 5.1 | □□□□□ -1.59 | | |
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| BRD3 | Q15059 | BX323845.1-201 | ENST00000432417 | 179 nt | BASIC | 5.1 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | LINC02257-202 | ENST00000433576 | 720 nt | TSL 5 BASIC | 5.1 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | ATP5F1P1-201 | ENST00000433775 | 569 nt | BASIC | 5.1 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | STXBP4-204 | ENST00000434978 | 2807 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.1 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL161937.1-201 | ENST00000444478 | 425 nt | TSL 3 BASIC | 5.1 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | LINC01034-201 | ENST00000448806 | 277 nt | TSL 3 BASIC | 5.1 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | SLC31A1P1-201 | ENST00000451221 | 567 nt | BASIC | 5.1 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | APOA2-207 | ENST00000470459 | 416 nt | TSL 5 BASIC | 5.1 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | OR5H5P-201 | ENST00000503164 | 928 nt | BASIC | 5.1 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC091951.3-201 | ENST00000504093 | 246 nt | BASIC | 5.1 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | ADGRL3-203 | ENST00000506700 | 4838 nt | TSL 5 BASIC | 5.1 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC083795.2-201 | ENST00000510034 | 610 nt | TSL 3 BASIC | 5.1 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | MTCO3P44-201 | ENST00000510977 | 541 nt | BASIC | 5.1 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC079395.1-201 | ENST00000510981 | 262 nt | BASIC | 5.1 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC097515.1-202 | ENST00000511818 | 371 nt | TSL 3 BASIC | 5.1 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | SCARNA21.2-201 | ENST00000516600 | 166 nt | BASIC | 5.1 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU4ATAC10P-201 | ENST00000516967 | 122 nt | BASIC | 5.1 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | IGLV2-28-201 | ENST00000520681 | 304 nt | BASIC | 5.1 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | MAL2-208 | ENST00000523307 | 556 nt | TSL 4 BASIC | 5.1 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | AP003170.4-201 | ENST00000543486 | 586 nt | TSL 3 BASIC | 5.1 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL133370.1-201 | ENST00000554679 | 537 nt | TSL 3 BASIC | 5.1 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | MLH3-212 | ENST00000556740 | 4491 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.1 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | ARPP19-205 | ENST00000563566 | 568 nt | TSL 4 BASIC | 5.1 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | LINC02168-201 | ENST00000565327 | 352 nt | TSL 2 BASIC | 5.1 | □□□□□ -1.59 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL032819.1-201 | ENST00000568554 | 379 nt | TSL 3 BASIC | 5.1 | □□□□□ -1.59 | | |