Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC105036.1-201ENST00000566222 271 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 RPL23AP73-201ENST00000492507 471 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
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