Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ITGA9Q13797 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
ITGA9Q13797 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
ITGA9Q13797 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.73
ITGA9Q13797 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC4.28□□□□□ -1.73
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