Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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SF3B2Q13435 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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SF3B2Q13435 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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SF3B2Q13435 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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SF3B2Q13435 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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SF3B2Q13435 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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