Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SP140Q13342 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SP140Q13342 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SP140Q13342 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SP140Q13342 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SP140Q13342 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SP140Q13342 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SP140Q13342 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SP140Q13342 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SP140Q13342 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SP140Q13342 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SP140Q13342 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SP140Q13342 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SP140Q13342 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SP140Q13342 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SP140Q13342 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SP140Q13342 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SP140Q13342 IQCJ-SCHIP1-AS1-201ENST00000460574 508 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SP140Q13342 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SP140Q13342 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SP140Q13342 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SP140Q13342 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SP140Q13342 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SP140Q13342 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SP140Q13342 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SP140Q13342 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SP140Q13342 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SP140Q13342 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SP140Q13342 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SP140Q13342 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SP140Q13342 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SP140Q13342 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SP140Q13342 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SP140Q13342 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SP140Q13342 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SP140Q13342 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SP140Q13342 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SP140Q13342 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SP140Q13342 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SP140Q13342 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SP140Q13342 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SP140Q13342 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SP140Q13342 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SP140Q13342 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SP140Q13342 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SP140Q13342 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SP140Q13342 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SP140Q13342 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SP140Q13342 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SP140Q13342 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SP140Q13342 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SP140Q13342 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SP140Q13342 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SP140Q13342 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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SP140Q13342 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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SP140Q13342 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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SP140Q13342 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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SP140Q13342 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SP140Q13342 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SP140Q13342 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SP140Q13342 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SP140Q13342 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SP140Q13342 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SP140Q13342 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SP140Q13342 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SP140Q13342 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SP140Q13342 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SP140Q13342 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SP140Q13342 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SP140Q13342 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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