Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTP4A2Q12974 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
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