Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms