Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RPS29P62273 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RPS29P62273 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RPS29P62273 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RPS29P62273 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RPS29P62273 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RPS29P62273 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RPS29P62273 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RPS29P62273 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RPS29P62273 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RPS29P62273 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RPS29P62273 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RPS29P62273 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RPS29P62273 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RPS29P62273 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RPS29P62273 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RPS29P62273 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RPS29P62273 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RPS29P62273 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RPS29P62273 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RPS29P62273 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
RPS29P62273 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RPS29P62273 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
RPS29P62273 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RPS29P62273 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RPS29P62273 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RPS29P62273 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RPS29P62273 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RPS29P62273 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RPS29P62273 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
RPS29P62273 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
RPS29P62273 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
RPS29P62273 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
RPS29P62273 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RPS29P62273 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RPS29P62273 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RPS29P62273 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
RPS29P62273 LINC01013-205ENST00000458028 1345 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
RPS29P62273 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
RPS29P62273 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
RPS29P62273 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
RPS29P62273 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RPS29P62273 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
RPS29P62273 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
RPS29P62273 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RPS29P62273 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RPS29P62273 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RPS29P62273 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RPS29P62273 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RPS29P62273 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RPS29P62273 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RPS29P62273 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RPS29P62273 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AC012594.1-271ENST00000438635 736 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RPS29P62273 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RPS29P62273 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RPS29P62273 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RPS29P62273 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RPS29P62273 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RPS29P62273 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RPS29P62273 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RPS29P62273 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RPS29P62273 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RPS29P62273 PCA3_2.1-201ENST00000612507 409 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RPS29P62273 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RPS29P62273 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RPS29P62273 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RPS29P62273 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
RPS29P62273 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.9 ms