Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AC011473.1-201ENST00000601280 443 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
HOXD10P28358 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
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