Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 LINC01158-205ENST00000458253 747 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 CDY3P-201ENST00000454543 1618 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 GJA9-202ENST00000360786 1901 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
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