Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 MTCO1P8-201ENST00000416914 1523 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 AC099535.1-201ENST00000408928 371 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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LINC00587B1AMM8 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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LINC00587B1AMM8 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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LINC00587B1AMM8 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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LINC00587B1AMM8 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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LINC00587B1AMM8 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 AC003991.1-201ENST00000594469 484 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
LINC00587B1AMM8 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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