Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PDGFDQ9GZP0 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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