Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC121758.1-202ENST00000556917 658 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FXNQ16595 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FXNQ16595 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FXNQ16595 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FXNQ16595 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FXNQ16595 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FXNQ16595 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FXNQ16595 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FXNQ16595 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FXNQ16595 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FXNQ16595 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FXNQ16595 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FXNQ16595 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FXNQ16595 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FXNQ16595 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FXNQ16595 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FXNQ16595 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FXNQ16595 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FXNQ16595 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FXNQ16595 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FXNQ16595 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FXNQ16595 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FXNQ16595 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FXNQ16595 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FXNQ16595 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FXNQ16595 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FXNQ16595 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FXNQ16595 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FXNQ16595 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FXNQ16595 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FXNQ16595 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FXNQ16595 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FXNQ16595 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FXNQ16595 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FXNQ16595 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FXNQ16595 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FXNQ16595 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FXNQ16595 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FXNQ16595 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.6 ms