Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
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SEC23BQ15437 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
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SEC23BQ15437 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
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