Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.8 ms