Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
RFTN1Q14699 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RFTN1Q14699 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RFTN1Q14699 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RFTN1Q14699 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RFTN1Q14699 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RFTN1Q14699 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RFTN1Q14699 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RFTN1Q14699 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RFTN1Q14699 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RFTN1Q14699 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RFTN1Q14699 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RFTN1Q14699 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RFTN1Q14699 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RFTN1Q14699 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RFTN1Q14699 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RFTN1Q14699 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RFTN1Q14699 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RFTN1Q14699 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RFTN1Q14699 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RFTN1Q14699 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RFTN1Q14699 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RFTN1Q14699 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RFTN1Q14699 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RFTN1Q14699 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RFTN1Q14699 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RFTN1Q14699 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RFTN1Q14699 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RFTN1Q14699 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RFTN1Q14699 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RFTN1Q14699 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.8 ms