Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AC018816.1-205ENST00000489771 509 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AC006946.3-201ENST00000609791 756 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms