Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 SSXP3-201ENST00000442971 1300 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
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TOP3AQ13472 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
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TOP3AQ13472 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
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TOP3AQ13472 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 YRDCP3-201ENST00000456507 480 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
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TOP3AQ13472 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
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