Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 C4orf33-202ENST00000425929 1588 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
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TCOF1Q13428 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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TCOF1Q13428 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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TCOF1Q13428 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 ZSCAN4-202ENST00000612521 1979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
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