Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 FSD1L-202ENST00000374710 7664 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 GABRA6-207ENST00000523217 2393 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 AC123769.2-201ENST00000624332 5984 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 CASP8-203ENST00000323492 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 PGK2-201ENST00000304801 1657 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 TTC7B-201ENST00000328459 19458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 ECT2-201ENST00000232458 4087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AL359694.1-201ENST00000403247 604 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 SERHL2-204ENST00000407614 521 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC091390.2-201ENST00000432573 374 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 TTLL4-210ENST00000442769 3971 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC022498.1-201ENST00000449845 696 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 RXFP1-207ENST00000470033 2175 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AL390198.2-201ENST00000510553 222 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC092375.1-201ENST00000550410 637 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 PEX13-201ENST00000295030 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC116366.1-201ENST00000443093 3730 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 ZNF214-201ENST00000278314 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 KAT6B-204ENST00000372724 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 BCL2L14-211ENST00000586576 1927 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
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FOXC1Q12948 SCARB2-211ENST00000638603 4284 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 CDHR3-201ENST00000317716 3813 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 INTS2-202ENST00000444766 5878 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 NEMP1-201ENST00000300128 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC096582.3-201ENST00000636578 3716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
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FOXC1Q12948 ADAM3A-205ENST00000481351 2379 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 EFCAB1-201ENST00000262103 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 TLR1-202ENST00000502213 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 ANGPT2-204ENST00000629816 2602 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 RIF1-201ENST00000243326 15003 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
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FOXC1Q12948 SNORA68-201ENST00000384437 133 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC018467.1-202ENST00000432612 533 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 RPL7AP23-201ENST00000482625 776 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC103718.1-201ENST00000522667 683 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC026956.1-201ENST00000558741 396 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
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