Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
FOXO1Q12778 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
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