Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
APOBRQ0VD83 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
APOBRQ0VD83 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
APOBRQ0VD83 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
APOBRQ0VD83 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
APOBRQ0VD83 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
APOBRQ0VD83 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
APOBRQ0VD83 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
APOBRQ0VD83 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
APOBRQ0VD83 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
APOBRQ0VD83 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
APOBRQ0VD83 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
APOBRQ0VD83 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
APOBRQ0VD83 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
APOBRQ0VD83 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
APOBRQ0VD83 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
APOBRQ0VD83 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
APOBRQ0VD83 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
APOBRQ0VD83 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
APOBRQ0VD83 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
APOBRQ0VD83 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
APOBRQ0VD83 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
APOBRQ0VD83 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
APOBRQ0VD83 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
APOBRQ0VD83 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
APOBRQ0VD83 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
APOBRQ0VD83 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
APOBRQ0VD83 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
APOBRQ0VD83 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
APOBRQ0VD83 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
APOBRQ0VD83 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
APOBRQ0VD83 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
APOBRQ0VD83 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
APOBRQ0VD83 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
APOBRQ0VD83 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
APOBRQ0VD83 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms