Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
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USP18Q9UMW8 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
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USP18Q9UMW8 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
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