Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
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USP35Q9P2H5 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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USP35Q9P2H5 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
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