Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 TRPM6-204ENST00000449912 8244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms