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| ATXN7L3 | Q14CW9 | AC084783.1-201 | ENST00000565846 | 910 nt | BASIC | 3.64 | □□□□□ -1.83 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | EIF4A2P1-201 | ENST00000587313 | 1063 nt | BASIC | 3.64 | □□□□□ -1.83 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | AC020914.4-201 | ENST00000597690 | 277 nt | BASIC | 3.64 | □□□□□ -1.83 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | AC008687.2-201 | ENST00000597865 | 520 nt | BASIC | 3.64 | □□□□□ -1.83 | | |
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| ATXN7L3 | Q14CW9 | AC021851.1-201 | ENST00000608537 | 1082 nt | BASIC | 3.64 | □□□□□ -1.83 | | |
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| ATXN7L3 | Q14CW9 | THEMIS-204 | ENST00000537166 | 3830 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | FRYL-205 | ENST00000503238 | 11103 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | AC079741.1-201 | ENST00000321498 | 212 nt | BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | RNA5SP175-201 | ENST00000364275 | 119 nt | BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
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| ATXN7L3 | Q14CW9 | POLR1D-202 | ENST00000399696 | 668 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | LINC01709-201 | ENST00000415532 | 634 nt | TSL 5 BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | AL359633.2-201 | ENST00000415787 | 622 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
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| ATXN7L3 | Q14CW9 | AC246680.2-201 | ENST00000422106 | 389 nt | BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | SLC16A12-AS1-201 | ENST00000423474 | 405 nt | TSL 3 BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | LINC01473-202 | ENST00000427108 | 695 nt | TSL 5 BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
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| ATXN7L3 | Q14CW9 | AC010975.1-201 | ENST00000443301 | 669 nt | TSL 3 BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | AC025947.1-201 | ENST00000447943 | 299 nt | TSL 5 BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
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| ATXN7L3 | Q14CW9 | AL513533.1-201 | ENST00000453728 | 415 nt | BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | PTCHD1-AS-201 | ENST00000455399 | 718 nt | TSL 3 BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | AL592161.1-201 | ENST00000456389 | 861 nt | TSL 3 BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | AL049548.1-201 | ENST00000458194 | 385 nt | TSL 2 BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | S100A11P1-201 | ENST00000477525 | 312 nt | BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | RPL21P103-201 | ENST00000479921 | 488 nt | BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
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| ATXN7L3 | Q14CW9 | AC139713.2-213 | ENST00000505000 | 796 nt | TSL 2 BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | AC139718.1-201 | ENST00000508010 | 300 nt | TSL 5 BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | LINC01218-201 | ENST00000515150 | 481 nt | TSL 3 BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | RN7SKP277-201 | ENST00000516895 | 283 nt | BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | AC100871.2-201 | ENST00000522005 | 327 nt | TSL 3 BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | IGJP1-201 | ENST00000522682 | 475 nt | BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | RGS4-207 | ENST00000527809 | 817 nt | TSL 4 BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | AP000827.1-201 | ENST00000527814 | 258 nt | BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | AC023034.1-201 | ENST00000558141 | 518 nt | TSL 3 BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |