Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
DDX39BQ13838 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.6 ms