Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 ARV1-202ENST00000366658 1170 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 AL359634.1-201ENST00000429807 1179 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 LINC01158-205ENST00000458253 747 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TCOF1Q13428 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 RPL5P16-201ENST00000471467 790 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TCOF1Q13428 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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