Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AC008759.1-201ENST00000589783 983 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
GRIK2Q13002 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC4.53□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC4.53□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms