Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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RASGEF1BQ0VAM2 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
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RASGEF1BQ0VAM2 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
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RASGEF1BQ0VAM2 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
RASGEF1BQ0VAM2 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
RASGEF1BQ0VAM2 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
RASGEF1BQ0VAM2 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.76
RASGEF1BQ0VAM2 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
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