Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
E2F1Q01094 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms